STKINDIEX('','ATR',0,4,-1,500)和REF(STKINDIEX('','ATR',0,4,0,500),1)是一回事吗？
不一样，比如：当前周期是日线，被引用的是五分钟。我用下面的代码直接测试的，这样比较直观：
a:STKINDIEX('','T1.cc',0,2,-1,1000);
a2:ref(STKINDIEX('','T1.cc',0,2,0,1000),1)；
被引用指标T1：
cc:c;
如果我在小周期中引用大周期避免信号闪烁和反复加载，用REF和偏移-1哪个更好呢？
你小周期引用大周期存在闪烁问题，常用的解决方法是向前引用1根k线，指的是被引用的大周期。（stkindi函数向前引用都是指的被引用的公式）
而ref，指的是当前使用的周期，也就是当前周期的上N根数据。所以、两个函数的作用类似，当时用途有区别。
例如：5分钟引用60分钟周期数据：
ref(c,1);//指的是上一根5分钟周期的收盘价
stkindi(....,-1);//指的是60分钟周期下，上一根60分钟周期的收盘价
ref(stkindi(...),1);//指的是上一根5分钟周期上对应的60分钟周期上的收盘价。所以，行情按时间对齐的原则，60分钟中包含14根5分钟周期，也就是说会有14根5分钟周期引用的结果都是同一根60分钟周期的值。（你可以自己写个测试代码看下指标线的走势就能很好理解）
关于你说的ref和stkindi中的偏移问题，是需要看你要处理的是当前周期还是引用的其他周期，并不能明确指明谁更好用